Unit transkripsi aktif dikelompokkan dalam nukleus, di tapak diskret yang dipanggil kilang transkripsi atau eukromatin. Tapak sedemikian boleh ditampakkan dengan membenarkan polimerase terlibat memanjangkan transkripnya dalam pelopor berteg (Br-UTP atau Br-U) atau dengan imunopelabelan RNA baharu yang diteg. Kilang transkripsi juga boleh disetempatkan menggunakan penghibridan in situ pendarfluor atau ditandai oleh antibodi yang diarahkan terhadap polimerase. Terdapat ~10,000 kilang dalam nukleoplasma sel HeLa, antaranya ialah ~8,000 kilang polimerase II dan ~2,000 kilang polimerase III. Setiap kilang polimerase II mengandungi ~8 polimerase. Memandangkan kebanyakan unit transkripsi aktif dikaitkan dengan hanya satu polimerase, setiap kilang biasanya mengandungi ~8 unit transkripsi yang berbeza. Unit ini mungkin dikaitkan melalui promoter dan/atau penambah dengan gelung membentuk "awan" di sekeliling faktor tersebut.[60]